Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms