Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms