Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P61574 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms