Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MDH1P40925 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms