Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PPARGP37231 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms