Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms