Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms