Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD10P28358 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD10P28358 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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