Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms