Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms