Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COCHO43405 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COCHO43405 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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COCHO43405 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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