Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms