Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms