Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRHQ9HD43 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms