Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms