Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms