Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms