Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM46DQ8NEK8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM46DQ8NEK8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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