Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXO39Q8N4B4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms