Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM48Q8IWZ4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM48Q8IWZ4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM48Q8IWZ4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM48Q8IWZ4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM48Q8IWZ4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM48Q8IWZ4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TRIM48Q8IWZ4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM48Q8IWZ4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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