Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMNL3Q8IVF7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms