Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APTXQ7Z2E3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APTXQ7Z2E3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms