Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.2 ms