Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms