Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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