Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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