Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TROQ12816 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TROQ12816 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TROQ12816 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TROQ12816 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TROQ12816 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TROQ12816 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TROQ12816 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TROQ12816 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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