Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms