Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms