Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIN3BO75182 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms