Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN16Q9Y5I7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLDN16Q9Y5I7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms