Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms