Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED13Q9UHV7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED13Q9UHV7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms