Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEMTQ9UBM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PEMTQ9UBM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEMTQ9UBM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms