Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDND1Q9NY35 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDND1Q9NY35 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms