Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
XPNPEP3Q9NQH7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms