Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD3Q9NPG1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms