Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TDRD3Q9H7E2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms