Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP44Q9C0F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms