Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX50Q9BQ39 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms