Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms