Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SIN3AQ96ST3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIN3AQ96ST3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms