Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACCSQ96QU6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms