Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM143Q96AN5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms