Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1BQ8WUY9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEPDC1BQ8WUY9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms