Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL23Q8NBE8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL23Q8NBE8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms