Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CMTR1Q8N1G2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CMTR1Q8N1G2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CMTR1Q8N1G2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms