Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap20Q8BTU1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap20Q8BTU1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap20Q8BTU1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms