Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM46Q7Z4K8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM46Q7Z4K8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms