Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms